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キーワード検索から
ユニット/領域名から
プラットフォーム機能最適化ユニット
データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援
電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
講習会・セミナーの実施、広報活動
医薬関連情報データベースの構築・公開とVaProSの高度化
知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析
構造解析ユニット(構造解析領域)
SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析
SPring-8遠隔実験支援システム
高エネルギーX線を利用した結晶構造解析
SPring-8:温湿度制御(HAG法)による生理活性状態での構造変化の解析
SPring-8タンパク質溶液散乱測定
X線自由電子レーザーを用いたシリアルフェムト秒結晶構造解析法
KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム
KEK-PF天然タンパク質に含まれる硫黄原子を利用したタンパク質の構造解析
KEK-PF生体高分子X線溶液散乱
KEKクライオ電子顕微鏡による単粒子解析に向けたデータ測定
創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援
生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)
高分解能クライオ電子顕微鏡解析
NMR生体分子構造相互作用解析
NMRによるタンパク質の相互作用解析
クライオ電顕ネイティブ複合体解析
クライオ電子顕微鏡による構造解析(トモグラフィー・単粒子解析)
クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化
クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質の単粒子解析
構造解析ユニット(タンパク質生産領域)
クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術
高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産
創薬ターゲットに対する構造認識抗体/バインダーの生産支援
エピジェネティクス研究と創薬のための再構成クロマチンの提供
コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製
高難度モノクローナル抗体開発とその包括的エンジニアリング
次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援
創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化
無細胞系・生細胞系による高難度タンパク質生産支援
単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産
X線結晶構造解析のための全自動大規模結晶化スクリーニング
ケミカルシーズ・リード 探索ユニット(ライブラリー・スクリーニング領域)
化合物ライブラリー
ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索
大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供
創薬機構の化合物スクリーニング支援
感染症創薬スクリーニング支援
海洋微生物抽出物ライブラリーを用いた創薬スクリーニング支援
非RI細胞障害性アッセイシステム
特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援
スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)
ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化
疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)
動物モデルでの薬物動態解析
Structure-aided drug discovery
化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援
創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援
物理化学測定によるヒット・リード化合物結合の“質”評価
東北大学化合物ライブラリー
天然化合物に由来するケミカルスペースの開拓
需要に応じたスクリーニングシステム
簡便で安価なGPCR活性化測定法 -TGFα切断アッセイ-
ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析
細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術
300kVハイエンド透過型電子顕微鏡を用いたクライオ電子顕微鏡構造解析支援
大村天然化合物ライブラリー
抗体様分子標的HLHペプチドの開発
ケミカルシーズ・リード 探索ユニット(構造展開領域)
創薬研究の推進に向けた創薬コンサルティングと構造展開
低分子化合物の物性と
in vitro
ADMET評価
アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・リード創製)
アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・ADME/物性評価)
高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援
ヒット化合物の迅速プローブ化支援
天然物をはじめとする生物活性化合物の構造展開及び分子プローブ化
分子触媒を用いた物質変換法
有機分子へのハロゲン官能基の導入
遺伝学的アプローチによる薬剤標的分子の同定
高化学選択的有機合成手法による迅速な分子構造展開
アルカロイド様化合物を中心とした含窒素化合物の自在な構造展開
天然化合物を活用した構造展開とライブラリー構築・提供
ペプチドライブラリー合成・提供
遷移金属触媒を用いる多様な複素環化合物の合成
系内発生アミド塩基が触媒する複素芳香族炭素-水素結合の分子変換
効率的で汎用性の高い合成法によるマクロライド及び多環性炭素骨格の合成・提供
グリコペプチド抗生物質誘導体及びグアニン誘導体の合成
塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援
バイオロジカルシーズ探索ユニット
機能ゲノミクス解析による創薬等支援
微量検体からの高精度1塩基解像度メチローム解析
1細胞・微小組織サンプルからのトランスクリプトーム及び微生物1細胞ゲノム解析
ゲノム高次構造と転写ネットワークの統合的理解に向けた技術基盤提供支援
ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製
次世代型疾患モデル動物作出
エピゲノム疾患モデルマウス(シルバーラッセル症候群モデルマウス)
ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム
心血管安全性評価を通じた創薬支援
In vivo
薬物動態試験
In vivo
安全性試験
薬物動態イメージング解析
人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援
インシリコユニット
天然変性領域の構造アンサンブル解析とアミノ酸変異等の影響解析
低分解能実験データを用いた超分子の立体構造モデリング
分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析
タンパク質の相互作用予測、相互作用部位予測
バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング
X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究
タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究
ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)
スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援
インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析
分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援
中分子創薬ライブラリーユニット
タンパク質間相互作用阻害にフォーカスした中分子化合物ライブラリーの提供
支援メニュー目次から
タンパク質の試料調製で困っている方へ
組換えタンパク質の発現生産、精製を支援します。
高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産
単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産
無細胞系でのタンパク質の発現生産を支援します。
コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製
無細胞系・生細胞系による高難度タンパク質生産支援
核内タンパク質の発現生産を支援します。
エピジェネティクス研究と創薬のための再構成クロマチンの提供
膜タンパク質の発現生産、精製を支援します。
クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術
次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援
創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化
タンパク質と相互作用する(特殊)ペプチドを提供支援します。
特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援
抗体様分子標的HLHペプチドの開発
ペプチドライブラリー合成・提供
タンパク質の機能解析を支援します。
低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析
タンパク質の相互作用解析を支援します。
ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬
有用な低分子や中分子化合物を探したい方へ
化合物のスクリーニングのために各種測定装置の利用を支援します。
化合物ライブラリー
ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索
大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供
創薬機構の化合物スクリーニング支援
感染症創薬スクリーニング支援
スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)
化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援
創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援
需要に応じたスクリーニングシステム
化合物のスクリーニングを支援します。
化合物ライブラリー
ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索
大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供
創薬機構の化合物スクリーニング支援
感染症創薬スクリーニング支援
海洋微生物抽出物ライブラリーを用いた創薬スクリーニング支援
スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)
化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援
創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援
物理化学測定によるヒット・リード化合物結合の“質”評価
東北大学化合物ライブラリー
簡便で安価なGPCR活性化測定法 -TGFα切断アッセイ-
ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬
大村天然化合物ライブラリー
塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援
タンパク質間相互作用阻害にフォーカスした中分子化合物ライブラリーの提供
化合物の標的分子探索を支援します。
遺伝学的アプローチによる薬剤標的分子の同定
細胞の状態を制御する化合物のスクリーニングシステムを支援します。
非RI細胞障害性アッセイシステム
発見した有用化合物の構造最適化のための化学合成を支援します。
ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化
大村天然化合物ライブラリー
ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化
アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・リード創製)
高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援
ヒット化合物の迅速プローブ化支援
天然物をはじめとする生物活性化合物の構造展開及び分子プローブ化
分子触媒を用いた物質変換法
各種化合物の合成を支援します。
特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援
天然化合物に由来するケミカルスペースの開拓
抗体様分子標的HLHペプチドの開発
分子触媒を用いた物質変換法
有機分子へのハロゲン官能基の導入
高化学選択的有機合成手法による迅速な分子構造展開
アルカロイド様化合物を中心とした含窒素化合物の自在な構造展開
天然化合物を活用した構造展開とライブラリー構築・提供
ペプチドライブラリー合成・提供
遷移金属触媒を用いる多様な複素環化合物の合成
系内発生アミド塩基が触媒する複素芳香族炭素-水素結合の分子変換
効率的で汎用性の高い合成法によるマクロライド及び多環性炭素骨格の合成・提供
グリコペプチド抗生物質誘導体及びグアニン誘導体の合成
タンパク質に結合するリガンドのインシリコスクリーニングと構造最適化を支援します。
Structure-aided drug discovery
バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング
タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究
ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)
スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援
インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析
分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援
疾患モデルマウスを用いた化合物の薬効評価を支援します。
疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)
動物モデルでの薬物動態解析
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
薬物動態や毒性評価を支援します。
動物モデルでの薬物動態解析
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析
構造展開とADMET評価に基づく低分子創薬研究の推進
低分子化合物の物性と
in vitro
ADMET評価
アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・ADME/物性評価)
高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援
塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援
心血管安全性評価を通じた創薬支援
In vivo
薬物動態試験
In vivo
安全性試験
人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援
Patient-derived cells (PDC)を用いた創薬評価支援
動物を用いた実験を実施したい方へ
薬物動態解析を支援します。
疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)
動物モデルでの薬物動態解析
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム
In vivo
薬物動態試験
薬物動態イメージング解析
モデル動物の提供/作成を支援します。
疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)
疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製
次世代型疾患モデル動物作出
人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援
エピゲノム疾患モデルマウス(シルバーラッセル症候群モデルマウス)
毒性/安全性評価を支援します。
モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術
ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム
心血管安全性評価を通じた創薬支援
In vivo
安全性試験
細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術
タンパク質の構造解析を目指す方へ
タンパク質の結晶化を支援します。
高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産
コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製
創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化
X線結晶構造解析のための全自動大規模結晶化スクリーニング
タンパク質の結晶化を促進する抗体などの相互作用分子の設計、調製を支援します。
創薬ターゲットに対する構造認識抗体/バインダーの生産支援
コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製
高難度モノクローナル抗体開発とその包括的エンジニアリング
次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援
細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術
タンパク質の結晶構造解析のためのビームタイムを供給します。
SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析
SPring-8:温湿度制御(HAG法)による生理活性状態での構造変化の解析
KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム
生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)
タンパク質のX線回折データの収集を支援します。
SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析
SPring-8遠隔実験支援システム
高エネルギーX線を利用した結晶構造解析
KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム
KEK-PF生体高分子X線溶液散乱
創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援
生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)
タンパク質のX線回折データの位相決定及び構造解析を支援します。
KEK-PF天然タンパク質に含まれる硫黄原子を利用したタンパク質の構造解析
タンパク質のX線自由電子レーザによる構造解析を支援します。
X線自由電子レーザーを用いたシリアルフェムト秒結晶構造解析法
タンパク質のX線溶液散乱データの収集、解析を支援します。
Pring-8タンパク質溶液散乱測定
KEK-PF生体高分子X線溶液散乱
X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究
タンパク質のNMRによる相互作用解析を支援します。
創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援
NMR生体分子構造相互作用解析
NMRによるタンパク質の相互作用解析
タンパク質の電子顕微鏡による構造解析を支援します。
KEKクライオ電子顕微鏡による単粒子解析に向けたデータ測定
創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援
高分解能クライオ電子顕微鏡解析
クライオ電顕ネイティブ複合体解析
クライオ電子顕微鏡による構造解析(トモグラフィー・単粒子解析)
クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化
クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質の単粒子解析
クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術
単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産
300kVハイエンド透過型電子顕微鏡を用いたクライオ電子顕微鏡構造解析支援
構造バイオインフォマティクスの力を借りたい方へ
タンパク質の立体構造のモデリングを支援します。
データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援
電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析
低分解能実験データを用いた超分子の立体構造モデリング
タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究
スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援
分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援
タンパク質と他の分子との相互作用部位及び複合体構造の予測を支援します。
電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析
タンパク質の相互作用予測、相互作用部位予測
バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング
X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究
タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究
ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)
インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析
分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援
タンパク質の動的構造解析を支援します。
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
天然変性領域の構造アンサンブル解析とアミノ酸変異等の影響解析
分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析
X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究
スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援
タンパク質のアミノ酸配列に基づく各種解析を支援します。
電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析
タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究
ゲノムから始めたい方へ
エクソーム、トランスクリプトーム、メチローム解析を支援します。
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
機能ゲノミクス解析による創薬等支援
微量検体からの高精度1塩基解像度メチローム解析
ChIp-seq解析を支援します。
機能ゲノミクス解析による創薬等支援
ゲノム高次構造と転写ネットワークの統合的理解に向けた技術基盤提供支援
1細胞遺伝子発現解析を支援します。
1細胞・微小組織サンプルからのトランスクリプトーム及び微生物1細胞ゲノム解析
ゲノム編集を用いた疾患モデルマウス作成の支援をします。
ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製
次世代型疾患モデル動物作出
データを活用したい方へ
タンパク質および遺伝子のデータベースや解析ツールの利用を支援します。
データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援
電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用
ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定
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広報活動やセミナーを利用したい方へ
講習会、セミナーの開催と企画を支援します。
講習会・セミナーの実施、広報活動
支援申請する
E6-8 グリコペプチド抗生物質誘導体及びグアニン誘導体の合成
グリコペプチド抗生物質バンコマイシン等のペプチド化合物の化学修飾、8-ニトロcGMP等の希少ヌクレオチドの合成と誘導体化
[1] 支援担当者
所属
①東北大学 大学院生命科学研究科
氏名
①有本 博一
AMED
事業
ユニット/領域名
課題名
ケミカルシーズ・リード 探索ユニット(構造展開領域)
最先端の合成テクノロジーに立脚した自在な構造展開を可能にする創薬拠点
代表機関
代表者
東北大学
岩渕 好治
支援技術のキーワード
バンコマイシン誘導体、8-ニトロcGMP
[2] 支援技術の概要
グリコペプチド抗生物質バンコマイシンに例示されるペプチド化合物の化学修飾。
8-ニトロcGMPに例示される希少なヌクレオチドの合成や誘導体化。
[3] 支援技術の利用例
芳香環上に鈴木カップリングによりアルキル鎖を導入したバンコマイシン誘導体の合成と抗菌活性評価
18
O同位体標識した8-ニトロcGMPの合成と質量分析による代謝物解析
[4] 支援担当者の研究概要
バンコマイシン耐性菌VRE/VRSAに有効な抗菌活性を示すバンコマイシン誘導体の合成と評価
1)鈴木カップリングによるバンコマイシンの化学修飾(
J.Med.Chem
.,
2010
,53,2528)
2)マウスモデルにおいて治療効果を示すバンコマイシン2量体の合成(
Chem.Commun
.,
2007
,251)
3)内在性ソルターゼを利用した細胞壁イメージングの利用による抗生物質作用機序の解析(
Sci.Rep
.,
2017
,7,Article number:1129)
A群連鎖球菌の選択的オートファジー排除機構の解明(
Mol.Cell
,
2013
,52,794)
内因性ヌクレオチド:8-ニトロcGMPの同位体標識物を用いた代謝物研究(
Mol.BioSyst
.,
2012
,8,2909)
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